En seguida, sería presentado Ricardo Ferretti, un técnico de extensa trayectoria en el futbol Mexicano, camiseta españa vintage teniendo un fin en el torneo Clausura 2023 bastante gris al ser eliminados en repechaje ante Atlas. Su sustituto sería Joaquín Moreno, con quién no mejoraría la situación, terminando el Apertura 2023 en la posición número 16, solo por arriba de Atlas y Necaxa, igualando el mal torneo hecho en el Apertura 2004. Aún así, llegaría al equipo Ángel Sepúlveda desde Querétaro F. C., quien anotaría 9 goles, no siendo suficiente, terminando con la destitución de Joaquín Moreno. Sin embargo, en liga, al mando de Diego Aguirre, aunque comenzaría su andar por el torneo Apertura 2022 con una victoria ante Tigres, después sufriría con dos derrotas consecutivas, frente a Pachuca y Atlas. Para el inicio del Apertura 2023 se daría la salida de dos históricos del equipo, como lo eran José de Jesús Corona, tras 14 años en el equipo, y Julio César Domínguez, tras 17 años en el equipo, siendo incluso cantero y el único equipo en su carrera. Eso es lo que hace Alejandro Requeijo (Madrid, 1985) en Invasión de Campo (Pengüin Libros, 2023), un manifiesto contra el fútbol como negocio y en defensa del aficionado.
Tras una pretemporada satisfactoria, Cruz Azul disputaría el torneo Clausura 2023 con el «El Potro» Gutiérrez desde un inicio, donde las cosas no saldrían para nada bien obteniendo solo un punto en seis jornadas disputadas. El duelo sería en la cancha del Estadio Azteca aunque Cruz Azul sería el visitante administrativamente, pues su rival sería el América. Cruz Azul sería octavo general, teniendo que enfrentar como local al noveno general, que se trataba del Necaxa en partido único por el boleto a Cuartos de Final. Debido al formato de la liga mexicana, Cruz Azul tuvo que jugar un repechaje para clasificar a la liguilla contra el Club León, equipo que había quedado en el puesto 10 de la tabla. Cruz Azul sufrió la baja de hasta 12 futbolistas, entre los que destacaron Jonathan Rodríguez, Luis Romo, Orbelín Pineda, Roberto Alvarado, Guillermo Fernández y Yoshimar Yotún, pilares en la obtención del título de la liga. Ya bajo esta denominación, el equipo consiguió su primer ascenso a la Segunda División «B» en la temporada 1992-93 y se mantuvo en ella durante 4 años, hasta que el descenso a dicha categoría del primer equipo filial les relegó a regresar a la Tercera División, en donde se han mantenido desde entonces.
A la par que eso ocurría, la Máquina comenzó su aventura en la Concachampions 2022 enfrentándose al Forge FC de Canadá en los Octavos de Final. Cruz Azul se mediría a los Tigres de la UANL en los Cuartos de Final. El partido de ida terminó sin goles, mientras que el partido de vuelta lo ganaría Monterrey por 3-0, dejando a Cruz Azul eliminado de la liguilla. Los celestes cosecharon 22 unidades, producto de 5 triunfos, 8 empates y 4 derrotas, culminando como octavo lugar de la tabla general, debiendo jugar la Reclasificación a la Liguilla contra el noveno general: el CF Monterrey. La fase previa de grupos tuvo lugar entre septiembre y noviembre de 2018, y la fase final se disputó en junio de 2019 en Oporto y Guimarães (Portugal). ↑ Página oficial del Real Madrid (11 de junio de 2009). «El Padre de la cantera». El 9 de junio la Liga MX informó que el partido entre celestes y rojinegros sí tendría un título oficial de por medio, creándose así la Supercopa de la Liga MX, torneo que se disputará entre los último dos Campeón de Campeones, en caso de que un equipo se corone bicampeón de liga en la misma temporada.
Por el conjunto atlista Flores y el mismo Quiñones fallaron en sus cobros y con ello, Cruz Azul se impuso 4-3 en ‘penaltis’ para conseguir el vigésimo cuarto título oficial en su historia. En el Clausura 2022, Cruz Azul mantendría un paso irregular, además de que el plantel muy limitado hacía cada vez más complicado conseguir buenos resultados en ambos torneos. En el primer semestre de 2022, el principal objetivo del equipo era conquistar la Liga de Campeones de la Concacaf, torneo en que Cruz Azul participaba por tercer año consecutivo. La falta de gol y la pésima defensa (la peor en torneos cortos del equipo) provocarían que la trayectoria de Diego Aguirre se viniera abajo con cuatro derrotas consecutivas más, incluyendo una polémica derrota frente a Toluca de 3-2, donde el VAR pesó mucho en las decisiones arbitrales, y una dolorosa derrota frente al América de 7-0, siendo la mayor goleada que ha recibido el conjunto azul en su historia.